Zusammen mit ihrem Mann und Philippa Boyens schrieb sie das Drehbuch zur Herr der Ringe Filmtrilogie. Außerdem schrieb sie an einigen Filmsongs, beispielsweise Gollum's Songund Into the West mit. Fran Walsh war Mitproduzentin der Filmtrilogie und führte bei einigen Szenen Regie. Für die Schreie der Nazgûl wurden am Computer bearbeitete Schreie von Fran Walsh verwendet.
Auf den DVDs der Filmtrilogie gibt es weder Interviews noch Bilder oder Videoclips, in denen Fran Walsh zu sehen ist, weil sie so ihre Privatsphäre schützen möchte. Lediglich an den Audiokommentaren ist sie beteiligt.
Nach dem Drehbuch für eine neuseeländischen Neuverfilmung von King Kong (2005) hat sie zuletzt Alice Sebolds Roman In meinem Himmel (2010) für die Verfilmung wiederum unter Regisseur Peter Jackson adaptiert. Der Film kam international 2009 unter dem Namen The Lovely Bones in die Kinos.
Zusammen mit ihrem Mann Peter Jackson und Philippa Boyens arbeitete sie an der Drehbuch-Adaption des Romans Der kleine Hobbit von J. R. R. Tolkien mit
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